SAIC50. Concentración inhibitoria media, IC50. v3.8 beta

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Créditos
Sección de Apoyo Estadístico (SAI)
amaurandi@um.es, aurora.gonzalez2@um.es

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Explicación de cada método:

  • MÉTODO 1 : Regresión lineal simple y=f(x). [1]

    El primer método aplica a los datos el modelo de regresión lineal simple para estudiar cómo los cambios en la concentración de una sustancia afectan a la inhibición del proceso biológico que nos concierne de manera abrupta. Sustituyendo en la recta de regresión obtenida y= ax+b se encuentra la concentración x para la cual el porcentaje de inhibición es 50 % quedando 50 =ax+b lo que implica x= IC50 = 50-b⁄a .
  • MÉTODO 2 : Regresión lineal con cambio en el eje de abcisas z=log(x), y=f(z). [1]

    El cálculo del IC50 se hará de forma similar al anterior pero teniendo en cuenta que el eje de coordenadas es z=log(x) (logaritmo de las concentraciones).
    Así, en la curva obtenida mediante regresión y =az+b daremos a y el valor 50, quedando 50=az+b lo que implica z=50-b⁄a y a este se le calcula la exponencial: x = IC50 = e^z .
  • MÉTODO 3 (recomendado) : Regresión lineal con cambio en ambos ejes z=log(x), t= log(y⁄100-y), t=g(z). [2]

    Para el cálculo del IC50, en la curva obtenida mediante regresión t=az+b se da a t el valor 0 porque
    t = log(y⁄100-y ) y el objetivo es y=50, es decir, t= log( 50⁄100-50 )=log(1)=0.
    Ahora se tiene: 0 = az +b lo que implica z=-b⁄a y finalmente x = IC50 = e^z .
  • MÉTODO 4 (recomendado) : Método 3 eliminando observaciones para reducir el error. [2]
    El cuarto método borra sucesivamente todas las muestras de cada concentración y calcula la recta de regresión para elegir la que comete el menor error de ajuste. El cálculo del IC50 es exactamente igual que el del método anterior.

Resultados


              
Gráfico

              

              
                
                 Descargar resultados en un fichero tar
              
              

              En Linux: Desempaqueta el fichero tar con tar -xvf tufichero.tar 
 
              En Windows: Puedes emplear WinZip, 7-zip o cualquier otro programa
              

            

            

              
Disposición y extensión del archivo de datos

              
Crear fichero CSV

              
                    
Cómo crear el fichero CVS a partir de un fichero ODS (calc) o XLS (MS Excell):

                    
En el ods/excel están las concentraciones en una columna llamada 'x' y el factor de inhibición en la columna contigua llamada 'y' tal y como se aprecia en la imagen inferior.

                    
Seleccionar guardar como CSV separador  punto y coma, ';' y encoding  UTF-8.

                    
Datos de ejemplo 1

                    
Datos de ejemplo 2

                    

                    
              


              
Flujo del programa

              
Al cambiar el método en el panel de Opciones

              
                    
Cuando se cargan los datos se crea una carpeta OUT en el servidor.

                    
Por defecto, está seleccionado el primer método luego en esta carpeta OUT se guardarán el gráfico en .png y los resultados en .txt.

                    
Cada vez que se cambie de método en el panel de Opciones se guardarán los dos archivos mencionados correspondientes al método seleccionado en OUT.

                    
Es importante tener en cuenta que cuando se carguen nuevos datos esta carpeta OUT se borrará para guardar los nuevos datos. 

                    
Para conservar los resultados se deben descargar con el botón 'Descargar resultados' situado inmediatamente bajo la gráfica en el panel Resultados.

                    

                    
            

            

                
Referencias directas a los métodos

                 
                 
Otra bibliografía y referencias