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Usar datos de ejemplo para probar la aplicación

Métodos

Seleccione el método a aplicar:

Método 1: Regresión lineal simple

Método 2: Regresión lineal con cambio en el eje de abcisas

Método 3: Regresión lineal con cambio en ambos ejes

Método 4: Método 3 eliminando observaciones para reducir el error

Método 5: Regresión logística de 4 parámetros transformando el eje x en logarítmico (Por defecto)

Sección de Apoyo Estadístico

Sección de Cultivo de Tejidos

Indicaciones

Cargue un fichero .csv con el formato especificado en la página de ayuda.
Seleccione el método que quiera aplicar en el panel lateral.
Muévase a la pestaña de Resultados para verlos o descargarlos.

Vista del fichero CSV

Resultados

Gráfico

Descargar resultados en un fichero zip

En Linux: Desempaqueta el fichero zip con zip -xvf tufichero.zip
En Windows: Puedes emplear WinZip, 7-zip o cualquier otro programa

MÉTODO 1. Regresión lineal simple \(y = f(x)\)

MÉTODO 2. Regresión lineal con cambio en el eje de abscisas \(z = log(x), y=f(z)\)

MÉTODO 3. Regresión lineal con cambio en ambos ejes \(z = log(x)\), \(t = log (\frac{y}{100-y})\), \(t = g(z)\)

MÉTODO 4. Método 3 eliminando observaciones para reducir el error.

MÉTODO 5. Regresión logística con 4 parámetros \(y = d + \frac{a-d}{1+(\frac{c}{x})^b}\)

Presentación de ayuda

Descargar presentación de ayuda

Disposición y extensión del archivo de datos

Crear fichero CSV

Partimos de un fichero con extensión .ods/.xls, de Calc o MS Excell respectivamente, en el que habremos llamado 'x' a la columna de las concentraciones e 'y' al factor de inhibición en la columna contigua tal y como se aprecia en la imagen inferior.

Seleccionamos guardar como .csv indicando como separador punto y coma, ';' y encoding UTF-8.

NOTA: Por la transformación logarítmica del eje x se recomienda no escribir los datos de control (concentración = 0).

Flujo del programa

Al cambiar el método en el panel de Opciones

Cuando se cargan los datos se crea una carpeta OUT en el servidor.

Por defecto, está seleccionado el quinto método luego en esta carpeta OUT se guardarán el gráfico en .png y los resultados en .txt.

Cada vez que se cambie de método en el panel de Opciones se guardarán los dos archivos mencionados correspondientes al método seleccionado en OUT.

Es importante tener que cada vez que se selecciona un nuevo método, se borran los resultados anteriores de la carpeta OUT.

Para conservar los resultados se deben descargar con el botón 'Descargar resultados' situado inmediatamente bajo la gráfica en el panel Resultados.

Referencias directas a los métodos

(2014, 27 de Febrero) How to calculate IC50 Sciencegateway.org
Commo, Frederic y Bot, Briant (2016). R package nplr: n-parameter logistic regressions cran.r-project.org
Sebaugh, J.L. (2011). Guidelines for accurate EC50/IC50 estimation. Pharmaceutical Statistics 10(2), 128-134. onlinelibrary.wiley.com
H. Wickham. ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis. Springer-Verlag New York, 2009. cran.r-project.org

Otra bibliografía y referencias

Maurandi Lopez, Antonio; del Río Alonso, Laura y Balsalobre Rodríguez, Carlos (2013). Fundamentos estadísticos para investigación. Introducción a R. Murcia: Bubok Publishing S.L.
James, Gareth; Witten, Daniela; Hastie, Trevor y Tibshirani, Rober (2013). An Introduction to Statistical Learning with Aplications in R. New York: Springer.
Sección de Apoyo Estadístico, SAI, Univ de Murcia. web, Blog.

SAIC50 Concentración inhibitoria media. v: 1.5.10